北京大學生物醫學前沿創新中心

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邢棟

BIOPIC、ICG 研究員

個人履歷

2024-至今，北京大學生物醫學前沿創新中心(BIOPIC)，主任助理

2019-至今，北京大學生物醫學前沿創新中心(BIOPIC)，研究員

2012-2019，哈佛大學，博士后

主要研究方向

DNA是主要的遺傳物質。在真核細胞中，在維持轉錄和復制等重要生物學功能的同時，線性長度可達數米的基因組DNA能夠被高度折疊包裹在直徑只有幾微米的細胞核中。對細胞核內基因組的研究是理解遺傳信息的表達和傳遞的關鍵。本課題組致力于發展在單細胞中探索基因組結構和功能的測序技術，主要包括全基因的精確測量，染色體三維空間結構的重構，染色質開放區域的觀測，核小體的定位以及蛋白質與DNA的相互作用的測定等方面。并以此為核心對基因組穩定性、基因表達調控和基因組的三維結構與功能等領域的基本生物學問題展開深入研究。同時在此基礎上深入探索與基因組異常相關的重大疾病的分子機理和潛在的治療策略。

代表性論文及論著

Liu Z, Chen Y, Xia Q, Liu M, Xu H, Chi Y, Deng Y, Xing D. Linking genome structures to functions by simultaneous single-cell Hi-C and RNA-seq. Science. 2023 Jun 9;380(6649):1070-1076. doi: 10.1126/science.adg3797. Epub 2023 Jun 8. PMID: 37289875.
L. Tan, D. Xing, N. Daley, X. S. Xie, Three-dimensional genome structures of single sensory neurons in mouse visual and olfactory systems. Nat Struct Mol Biol 26, 297-307 (2019).
L. Tan, D. Xing, C. H. Chang, H. Li, X. S. Xie, Three-dimensional genome structures of single diploid human cells. Science 361, 924-928 (2018).
C. Chen, D. Xing, L. Tan, H. Li, G. Zhou, L. Huang, X. S. Xie, Single-cell whole-genome analyses by Linear Amplification via Transposon Insertion (LIANTI). Science 356, 189-194 (2017).
Z. Liu, D. Xing, Q. P. Su, Y. Zhu, J. Zhang, X. Kong, B. Xue, S. Wang, H. Sun, Y. Tao, Y. Sun, Super-resolution imaging and tracking of protein-protein interactions in sub-diffraction cellular space. Nat Commun 5, 4443 (2014).
S. Kim, E. Brostromer, D. Xing, J. Jin, S. Chong, H. Ge, S. Wang, C. Gu, L. Yang, Y. Q. Gao, X. D. Su, Y. Sun, X. S. Xie, Probing allostery through DNA. Science 339, 816-819 (2013).